| 方向名称 | 课程类别 | 课程名称 | 学分 | 开课学期 |
| 生物数学方向 | 专业必修 | 概率论与数理统计II | 3 | 三（1） |
| 线性规划 | 3 | 三（1） | ||
| 生物信息学 | 3 | 三（2） | ||
| 凸优化 | 3 | 三（2） | ||
| 小计 | 12 | |||
| 专业选修 | 算法与数据结构 | 4 | 三（2） | |
| 神经科学导论 | 3 | 四（1）/四（2） | ||
| 系统生物学导论 | 2 | 四（1）/四（2） | ||
| 计算生物学 | 2 | 四（1）/四（2） | ||
| 数据库与数据挖掘 | 4 | 四（1）/四（2） | ||
| 计算理论 | 4 | 四（1）/四（2） | ||
| 深度学习 | 4 | 四（1）/四（2） | ||
| 机器学习 | 4 | 四（1）/四（2） | ||
| 随机过程 | 4 | 四（1）/四（2） | ||
| 离散数学 | 3 | 四（1）/四（2） | ||
| 偏微分方程数值解 | 3 | 四（1）/四（2） | ||
| 小计 | 6 |